Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms