Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSEN1P49768 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms