Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ETV4P43268 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ETV4P43268 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV4P43268 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms