Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCAMP43121 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCAMP43121 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCAMP43121 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCAMP43121 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms