Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FDFT1P37268 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms