Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA4P35212 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJA4P35212 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms