Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms