Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCAP28676 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCAP28676 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCAP28676 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms