Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms