Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms