Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

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Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNCP24821 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNCP24821 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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