Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms