Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA1P20827 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms