Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRAP18433 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRAP18433 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRAP18433 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PTPRAP18433 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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