Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms