Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB3P14651 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms