Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFAPP14136 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFAPP14136 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFAPP14136 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFAPP14136 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFAPP14136 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFAPP14136 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms