Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms