Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF35P13682 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF35P13682 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms