Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCP08575 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCP08575 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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