Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms