Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC24DO94855 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms