Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms