Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP9BO43861 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms