Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COCHO43405 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COCHO43405 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COCHO43405 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COCHO43405 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms