Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC11O43248 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms