Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3AO14802 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms