Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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