Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms