Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
B4DXG7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
B4DXG7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
B4DXG7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms