Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM233B4DJY2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms