Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGB1P1B2RPK0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms