Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms