Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCSK1NQ9UHG2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCSK1NQ9UHG2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms