Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN2Q9UHD9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN2Q9UHD9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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