Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms