Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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