Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4Q9P0V3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4Q9P0V3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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