Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms