Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf109Q9NX04 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms