Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LHX9Q9NQ69 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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