Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms