Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB18Q9NP72 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms