Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFGAP3Q9NP61 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFGAP3Q9NP61 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms