Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLSPNQ9HAW4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLSPNQ9HAW4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms