Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms