Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP3-1Q9BYR8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms