Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms