Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms