Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2Q9BX26 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms